《神秘研究院，爱学习不良人免费》是一部充满活力、感人至深的青春电影，讲述了一群高中生在成长过程中面临的各种挑战和机遇。影片以幽默诙谐的笔触展现了青春期特有的迷惘、叛逆和热血，同时也发人深省地探討了教育、家庭和友谊等话题。

电影的主人公郑薇（杨子姗饰）是一位成绩优异、性格内向的女孩，她一直以来都以优异的成绩位居班上第一名她是学校里的尖子生，她的梦想是考上清华大学。然而，随着高三的到来，郑薇开始面临越来越大的升学压力，她的学习成绩也逐渐下降。同时，她也对自己的专业选择和未来感到迷茫。

在一次偶然的机会，郑薇认识了音乐才华横溢的男孩苗然（董子健饰）。苗然虽然成绩不佳，但他对梦想抱有强烈的执着，他鼓励郑薇勇敢地追求自己的梦想。在苗然的帮助下，郑薇逐渐找回了学习的动力，同时她也对自己的专业选择有了更清晰的认识。