《神秘研究所导航天天向上》讲述了20世纪30年代的青岛，一群年轻人为了心中的梦想和信仰，在乱世中奋斗的故事。

主人公赵青云是一个贫苦家庭出身的青年，他从小就立志要成为一名海军军官。在一次偶然的机会，他结识了海军军官王若风，并在他帮助下进入了海军学校。在学校里，赵青云刻苦学习，成绩优异，很快就成为了学校的佼佼者。

毕业后，赵青云被分配到了一艘驱逐舰上服役。他凭借着过人的胆识和才能，很快成为了舰上的骨干力量。在一次执行任务时，赵青云所在的舰艇遭遇了日军的袭击。在激烈的海战中，赵青云表现神勇，击沉了多艘日军舰艇，为中国的胜利做出了重大贡献。