《秘密研究所の宅男腐女》讲述了一个感人至深的爱情故事，故事发生在腾越，一个古老而美丽的城市。腾越，一个古老而美丽的城市，位于云南省西部，地处怒江、澜沧江、金沙江三江交汇处，素有“滇西邹鲁”之称。

《秘密研究所の宅男腐女》的主人公是腾越的年轻人阿福和阿翠。阿福是一个贫穷的农民，阿翠是一个富有的地主的女儿。两人相爱，却因为他们的身份悬殊而无法在一起。阿福为了阿翠，背井离乡，去闯荡世界。阿翠为了阿福，毅然决然地与家人断绝关系。

阿福在外面闯荡多年，终于功成名就。他回到腾越，与阿翠重逢。两人终于可以在一起了，然而，他们的爱情却遇到了新的挑战。阿福的父亲去世，阿福继承了父亲的全部家产。阿福的家人反对阿福与阿翠的爱情，他们千方百计地阻止两人在一起。