《秘密研究院导航》是一部以现代都市为背景的爱情剧，讲述了都市男女在快节奏的生活中寻找真爱的故事。

该剧的男主人公西井幸人是一位年轻帅气、事业有成的白领。他有一个交往多年的女友，但由于性格不合，两人最终分手。分手后，西井幸人在一次偶然的机会下遇到了女主人公远野优里。远野优里是一位性格开朗、古灵精怪的女孩，她与西井幸人格外合拍。两人很快坠入爱河，并开始了一段甜蜜的恋情。

然而，就在西井幸人和远野优里的恋情发展顺利的时候，西井幸人的前女友突然出现，她试图挽回西井幸人的心。西井幸人陷入两难境地，他既不忍心伤害远野优里，也不想辜负前女友。就在他犹豫不决的时候，前女友做出了一个惊人的举动，她当着西井幸人和远野优里的面自杀了。