《神秘研究院爱学习不良人》第六季延续了前几季的精彩，以其独特的 forensic procedural 类型和颇具化学反应的搭档组合，吸引了大批忠实的观众。该季故事围绕着 Bones 和 Booth 的关系展开，他们经历了分手、复合、订婚等一系列变化，最终在最后一集结为连理。

除了主线剧情之外，第六季还穿插了许多有趣且发人深省的案件。例如，在其中一集中，Bones 和 Booth 调查了一起连环杀人案，受害者都是年轻女性，她们的尸体都被残忍地肢解并摆成奇怪的姿势。通过对证据的分析，Bones 和 Booth 最终发现凶手是一个变态的艺术家，他将受害者作为他的艺术品来创作。

在另一集中，Bones 和 Booth 调查了一起涉及到时间旅行的案件。一名男子声称他从未来穿越而来，并警告 Bones 和 Booth 将会发生一场毁灭性的灾难。Bones 和 Booth 一开始并不相信这名男子的说法，但随着调查的深入，他们发现了一些令人不安的证据，这让他们开始怀疑这名男子的话可能是真的。最终，Bones 和 Booth 成功地阻止了这场灾难的发生，并救下了数百万人的生命。